六神曲与建神曲均为曲类,因曲类多产在福建,以泉州此地产的质优,故六神曲又有建曲之称,因此人们往往认为建神曲就是六神曲,而实际上两药虽然在制作工艺上基本相同,但在药物组成和功效上却有所区别。
六神曲和建神曲同为发酵制成的曲剂，但两者处方、制法、功效皆不同。
六神曲 由鲜辣蓼、鲜青蒿、鲜苍耳子切碎，杏仁、赤小豆研末，和入麦麸、白面后，经发酵而成的曲剂，含有大量的酵母菌及挥发油、甙类、脂肪油、维生素B等成分，性温，味甘辛，具有健脾和胃、消食调中的功效。《本草正》曰：“神曲，味甘气平，炒黄入药，善助中焦土脏，健脾暖胃，消食下气，化滞调中。”
建神曲 由枳壳、枳实、香附、白芍、莪术、首乌、白扁豆、元胡、槟榔、良姜、青皮、川椒、大黄等43味药研为细末，加入碾碎的赤小豆、小麦、麦皮、面粉，再用青蒿、赤柱草、苍耳草煎汤，与上药和匀充分发酵，外表长出黄色菌丝后晒干烘烤，储藏4个月后再晒，刷去霉毛即可入药。其性温，味苦，具有健脾消食、理气化湿、解表功效。
此两种药虽同有健脾消食的作用，但建神曲含有薄荷、防风、荆芥、紫苏、柴胡等解表药，能搜风解表，对感冒头痛、头眩发热，加生姜煎汤温服，有很好的发汗解表作用；六神曲则没有解表作用。两药仅一字之差，但六神曲不等于建神曲，故不可相互代用
附：沉香曲的作用：疏表化滞，舒肝和胃。用于表邪未尽，肝胃气滞，胸闷脘胀，胁肋作痛，吞酸呕吐。
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