很多朋友在开始抗病毒前也曾纠结过到底用核苷类好呢还是干扰素好，我们在这里也介绍一下两类药物各有何优缺点。核苷类能直接抑制乙肝病毒复制，干扰素也有直接抗病毒作用，但主要是免疫调节剂，因而两类药物各有特点。
核苷类药物抑制病毒复制的作用较强，控制症状较快，几乎所有患者都能获得病毒抑制的治疗效果，干扰素呢治疗有效后较稳定，复发的少。如果干扰素治疗有效那是相当好的，但是因为每位患者对激发免疫的反应不一样，不是每位患者都有效。大概比例是普通干扰素大概三分之一有效，长效的大概一半患者有效。
干扰素的使用除了不一定有效外，它的使用也是有些禁忌症的，绝对禁忌证包括：妊娠或短期内有妊娠计划、具有精神分裂症或严重抑郁症等病史、未能控制的癫痫、失代偿期肝硬化、未控制的自身免疫性疾病、伴有严重感染，视网膜疾病，心衰，慢性阻塞性肺部等基础疾病。相对禁忌证包括：甲状腺疾病，既往抑郁症史，未控制的糖尿病、高血压，治疗前中性粒细胞计数<1.0×109/L和（或）血小板计数<50×109/L。
每个患者具体情况不同，要求不同，不能说哪种更好，只能说哪种更适合，需要考虑自己的年龄、工作条件、经济条件、过去的治疗和肝炎的程度等，选择最适合自己的。如果干扰素的治疗能获得疗效，当然用干扰素好，可以停药，疗效比较稳定，可以较快清除大三阳，但这样的效果不是每个人都能达到，而核苷类维持疗效是绝大多数患者都能获取的。
首先,我们可以看到的最直接的区别是干扰素是需要一个注射的过程,是皮下注射,而核苷酸类似物就更方便些,因为它是口服的。
其次，还有一个最重要的区别，目前认为干扰素是一个有限疗程的治疗，也就是说有停药的非常明确的标准，而我们把核苷酸类似物称为一个长期治疗药物，它的停药现在没有一个很确切的标准，需要长期治疗，但是这个长期是多长,目前来说还没有定论，所以，在临床上就会遇到这样的问题，如果这个病人是适合干扰素治疗的病人，但是没有给病人进行干扰素治疗，而选择了核苷酸类似物的话，那病人的治疗时间会很长，甚至是一生都需要治疗。
但很可惜的是干扰素的有效率比较低（≤40%）,所以干扰素也是有一定的适宜人群。在人群选择中，我们有几个指标：
再有一个是病毒定量，病毒定量正好和干扰素相反，病毒定量越低的人，打干扰素的效果会更好，病毒定量在10的6次方 copies/ml以下的患者会更合适打干扰素。
还有一个因素是年龄，年龄虽然不像刚才我们讲的转氨酶以及病毒定量那么重要，但是一般说来，年轻人用干扰素会相对好些;而年纪大的人因为有可能会有肝硬化，或者非常严重的肝纤维化，这时候打干扰素在安全性方面可能就会得不到保证。再者，因为干扰素是一个有限疗程的药物，我们是可以停药的，如果使用核苷酸类似物的话，我们不知道什么时候才能停药，所以对于有生育要求的年轻女性，更适合使用干扰素。
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